本回答は2017年8月時点のものです。
自賠責保険と障害年金は全く別の制度となっていますので、
症状固定日が両者の間で異なっても問題はありません。
障害認定日とは
障害年金は、障害認定日が訪れなければ申請することが出来ません。
障害認定日は、
「初診日から起算して1年6月経過日」または「それまでに治った日（症状固定日）」のいずれか早い方となります。
平成27年2月に交通事故に遭い、
平成28年8月に障害年金用診断書を書いてもらうということは、
「初診日から起算して1年6月経過日」を待って申請するということになります。
この場合、症状固定についての疑義は生じず何の問題もありません。
なお、自賠責保険からの損害賠償を受けるとのことですが、
その場合、事故日の翌月から起算して、最長36月の範囲内で支給停止が行われます。
障害年金の申請について
障害の状態によって等級が決まりますが、
提出書類によって、2級相当なのに3級となったり不支給となったりというケースが
数多くあります。
そのため関連書籍をご購入の上、申請されることをお勧めします。
また、障害の種類や県によっては支給率が44％(2012年)しかありません。
申請のチャンスは審査請求、再審査請求と3回ありますが、
1度目に失敗すると再審査請求で支給が決定するのは14.7%です。
慎重にご準備ください。
申請の流れはこちらにて解説していますので、ご参考にしてください。
社労士への依頼も合わせてご検討ください
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